Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms