Protein–RNA interactions for Protein: Q96DL1

NXPE2, NXPE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE2Q96DL1 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms