Protein–RNA interactions for Protein: Q96A23

CPNE4, Copine-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE4Q96A23 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE4Q96A23 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms