Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms