Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms