Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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CSNK2A3Q8NEV1 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CSNK2A3Q8NEV1 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CSNK2A3Q8NEV1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CSNK2A3Q8NEV1 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CSNK2A3Q8NEV1 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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