Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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FAM71DQ8N9W8 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
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FAM71DQ8N9W8 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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FAM71DQ8N9W8 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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FAM71DQ8N9W8 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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FAM71DQ8N9W8 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
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FAM71DQ8N9W8 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM71DQ8N9W8 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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