Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN19Q8N6F1 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms