Protein–RNA interactions for Protein: Q8N137

CNTROB, Centrobin, humanhuman

Predictions only

Length 903 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTROBQ8N137 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTROBQ8N137 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTROBQ8N137 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTROBQ8N137 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTROBQ8N137 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTROBQ8N137 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTROBQ8N137 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTROBQ8N137 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTROBQ8N137 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTROBQ8N137 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTROBQ8N137 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTROBQ8N137 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTROBQ8N137 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTROBQ8N137 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTROBQ8N137 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTROBQ8N137 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTROBQ8N137 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTROBQ8N137 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTROBQ8N137 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTROBQ8N137 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTROBQ8N137 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTROBQ8N137 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTROBQ8N137 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTROBQ8N137 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTROBQ8N137 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTROBQ8N137 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTROBQ8N137 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTROBQ8N137 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTROBQ8N137 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTROBQ8N137 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTROBQ8N137 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNTROBQ8N137 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNTROBQ8N137 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNTROBQ8N137 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNTROBQ8N137 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNTROBQ8N137 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNTROBQ8N137 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms