Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPAP2Q8IXW5 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms