Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC84Q86UT8 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC84Q86UT8 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC84Q86UT8 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC84Q86UT8 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC84Q86UT8 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC84Q86UT8 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC84Q86UT8 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC84Q86UT8 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC84Q86UT8 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC84Q86UT8 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC84Q86UT8 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC84Q86UT8 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC84Q86UT8 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC84Q86UT8 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC84Q86UT8 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC84Q86UT8 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC84Q86UT8 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC84Q86UT8 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC84Q86UT8 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC84Q86UT8 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC84Q86UT8 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC84Q86UT8 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC84Q86UT8 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC84Q86UT8 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC84Q86UT8 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC84Q86UT8 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC84Q86UT8 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC84Q86UT8 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC84Q86UT8 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC84Q86UT8 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC84Q86UT8 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms