Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms