Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF554Q86TJ5 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF554Q86TJ5 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF554Q86TJ5 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF554Q86TJ5 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF554Q86TJ5 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF554Q86TJ5 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF554Q86TJ5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF554Q86TJ5 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF554Q86TJ5 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF554Q86TJ5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF554Q86TJ5 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF554Q86TJ5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF554Q86TJ5 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF554Q86TJ5 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF554Q86TJ5 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF554Q86TJ5 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF554Q86TJ5 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF554Q86TJ5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF554Q86TJ5 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF554Q86TJ5 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF554Q86TJ5 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF554Q86TJ5 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF554Q86TJ5 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF554Q86TJ5 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF554Q86TJ5 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF554Q86TJ5 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF554Q86TJ5 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF554Q86TJ5 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF554Q86TJ5 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF554Q86TJ5 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF554Q86TJ5 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms