Protein–RNA interactions for Protein: Q86T20

SMIM29, Uncharacterized protein SMIM29, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM29Q86T20 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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