Protein–RNA interactions for Protein: Q6VVB1

NHLRC1, E3 ubiquitin-protein ligase NHLRC1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC1Q6VVB1 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms