Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUI1

CCDC144NL, Putative coiled-coil domain-containing protein 144 N-terminal-like, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144NLQ6NUI1 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCDC144NLQ6NUI1 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCDC144NLQ6NUI1 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CCDC144NLQ6NUI1 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCDC144NLQ6NUI1 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCDC144NLQ6NUI1 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCDC144NLQ6NUI1 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCDC144NLQ6NUI1 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCDC144NLQ6NUI1 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCDC144NLQ6NUI1 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCDC144NLQ6NUI1 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCDC144NLQ6NUI1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCDC144NLQ6NUI1 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCDC144NLQ6NUI1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCDC144NLQ6NUI1 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCDC144NLQ6NUI1 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCDC144NLQ6NUI1 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCDC144NLQ6NUI1 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CCDC144NLQ6NUI1 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCDC144NLQ6NUI1 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CCDC144NLQ6NUI1 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCDC144NLQ6NUI1 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCDC144NLQ6NUI1 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCDC144NLQ6NUI1 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CCDC144NLQ6NUI1 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CCDC144NLQ6NUI1 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CCDC144NLQ6NUI1 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCDC144NLQ6NUI1 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCDC144NLQ6NUI1 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCDC144NLQ6NUI1 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCDC144NLQ6NUI1 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCDC144NLQ6NUI1 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCDC144NLQ6NUI1 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCDC144NLQ6NUI1 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCDC144NLQ6NUI1 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCDC144NLQ6NUI1 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms