Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KHDC3LQ587J8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms