Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms