Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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