Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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