Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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