Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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PDCD1Q15116 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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PDCD1Q15116 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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