Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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