Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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