Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCLAFQ15004 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms