Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms