Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSPNQ14714 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms