Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
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