Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL4A6Q14031 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms