Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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SPTAN1Q13813 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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SPTAN1Q13813 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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