Protein–RNA interactions for Protein: Q13319

CDK5R2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R2Q13319 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK5R2Q13319 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5R2Q13319 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms