Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP1B1Q10567 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms