Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABPB1Q06547 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms