Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms