Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP7AQ04656 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms