Protein–RNA interactions for Protein: P61923

COPZ1, Coatomer subunit zeta-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ1P61923 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPZ1P61923 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms