Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VBP1P61758 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VBP1P61758 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VBP1P61758 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VBP1P61758 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VBP1P61758 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VBP1P61758 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VBP1P61758 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VBP1P61758 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VBP1P61758 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VBP1P61758 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VBP1P61758 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VBP1P61758 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VBP1P61758 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VBP1P61758 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VBP1P61758 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VBP1P61758 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VBP1P61758 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VBP1P61758 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VBP1P61758 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VBP1P61758 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VBP1P61758 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VBP1P61758 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VBP1P61758 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VBP1P61758 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VBP1P61758 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VBP1P61758 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VBP1P61758 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VBP1P61758 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VBP1P61758 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VBP1P61758 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VBP1P61758 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VBP1P61758 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VBP1P61758 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VBP1P61758 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VBP1P61758 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VBP1P61758 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VBP1P61758 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VBP1P61758 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VBP1P61758 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VBP1P61758 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VBP1P61758 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VBP1P61758 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VBP1P61758 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VBP1P61758 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VBP1P61758 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VBP1P61758 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VBP1P61758 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VBP1P61758 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VBP1P61758 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VBP1P61758 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VBP1P61758 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VBP1P61758 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VBP1P61758 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VBP1P61758 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VBP1P61758 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VBP1P61758 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VBP1P61758 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VBP1P61758 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VBP1P61758 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VBP1P61758 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VBP1P61758 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VBP1P61758 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VBP1P61758 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VBP1P61758 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VBP1P61758 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VBP1P61758 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VBP1P61758 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VBP1P61758 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VBP1P61758 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VBP1P61758 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VBP1P61758 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VBP1P61758 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VBP1P61758 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VBP1P61758 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VBP1P61758 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VBP1P61758 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VBP1P61758 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VBP1P61758 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VBP1P61758 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VBP1P61758 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VBP1P61758 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VBP1P61758 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VBP1P61758 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VBP1P61758 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VBP1P61758 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VBP1P61758 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VBP1P61758 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VBP1P61758 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VBP1P61758 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VBP1P61758 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VBP1P61758 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VBP1P61758 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VBP1P61758 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VBP1P61758 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VBP1P61758 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VBP1P61758 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VBP1P61758 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VBP1P61758 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VBP1P61758 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms