Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms