Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNAP25P60880 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms