Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CABP4P57796 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CABP4P57796 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CABP4P57796 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CABP4P57796 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CABP4P57796 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CABP4P57796 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CABP4P57796 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CABP4P57796 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CABP4P57796 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CABP4P57796 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CABP4P57796 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CABP4P57796 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CABP4P57796 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CABP4P57796 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CABP4P57796 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CABP4P57796 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CABP4P57796 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CABP4P57796 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CABP4P57796 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CABP4P57796 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CABP4P57796 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CABP4P57796 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CABP4P57796 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CABP4P57796 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CABP4P57796 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CABP4P57796 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CABP4P57796 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CABP4P57796 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CABP4P57796 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CABP4P57796 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CABP4P57796 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CABP4P57796 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CABP4P57796 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CABP4P57796 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CABP4P57796 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CABP4P57796 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CABP4P57796 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CABP4P57796 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CABP4P57796 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CABP4P57796 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CABP4P57796 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CABP4P57796 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CABP4P57796 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CABP4P57796 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CABP4P57796 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CABP4P57796 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CABP4P57796 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CABP4P57796 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CABP4P57796 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CABP4P57796 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CABP4P57796 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CABP4P57796 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CABP4P57796 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CABP4P57796 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CABP4P57796 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CABP4P57796 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CABP4P57796 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CABP4P57796 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CABP4P57796 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CABP4P57796 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CABP4P57796 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CABP4P57796 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CABP4P57796 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CABP4P57796 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CABP4P57796 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CABP4P57796 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CABP4P57796 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CABP4P57796 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CABP4P57796 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CABP4P57796 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CABP4P57796 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CABP4P57796 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CABP4P57796 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CABP4P57796 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CABP4P57796 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CABP4P57796 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CABP4P57796 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CABP4P57796 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CABP4P57796 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CABP4P57796 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CABP4P57796 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CABP4P57796 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CABP4P57796 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CABP4P57796 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CABP4P57796 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CABP4P57796 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CABP4P57796 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CABP4P57796 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CABP4P57796 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CABP4P57796 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CABP4P57796 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CABP4P57796 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CABP4P57796 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CABP4P57796 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CABP4P57796 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CABP4P57796 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CABP4P57796 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CABP4P57796 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CABP4P57796 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms