Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms