Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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RAB5CP51148 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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RAB5CP51148 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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RAB5CP51148 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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RAB5CP51148 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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RAB5CP51148 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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RAB5CP51148 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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RAB5CP51148 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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RAB5CP51148 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
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