Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TAF6P49848 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TAF6P49848 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TAF6P49848 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TAF6P49848 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TAF6P49848 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TAF6P49848 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TAF6P49848 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TAF6P49848 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TAF6P49848 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TAF6P49848 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF6P49848 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF6P49848 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF6P49848 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF6P49848 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF6P49848 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF6P49848 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF6P49848 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF6P49848 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF6P49848 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF6P49848 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF6P49848 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF6P49848 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF6P49848 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF6P49848 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF6P49848 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF6P49848 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF6P49848 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF6P49848 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF6P49848 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF6P49848 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF6P49848 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF6P49848 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF6P49848 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF6P49848 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF6P49848 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF6P49848 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF6P49848 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF6P49848 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF6P49848 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF6P49848 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF6P49848 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF6P49848 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF6P49848 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF6P49848 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF6P49848 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF6P49848 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF6P49848 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF6P49848 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF6P49848 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF6P49848 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF6P49848 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF6P49848 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF6P49848 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF6P49848 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF6P49848 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF6P49848 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF6P49848 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF6P49848 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF6P49848 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF6P49848 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF6P49848 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF6P49848 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF6P49848 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF6P49848 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF6P49848 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF6P49848 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF6P49848 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF6P49848 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TAF6P49848 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TAF6P49848 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TAF6P49848 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TAF6P49848 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TAF6P49848 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TAF6P49848 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TAF6P49848 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TAF6P49848 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TAF6P49848 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF6P49848 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF6P49848 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF6P49848 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF6P49848 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF6P49848 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF6P49848 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF6P49848 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF6P49848 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF6P49848 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF6P49848 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF6P49848 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF6P49848 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF6P49848 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF6P49848 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF6P49848 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF6P49848 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF6P49848 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF6P49848 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF6P49848 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF6P49848 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF6P49848 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF6P49848 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms