Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCT3P49368 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCT3P49368 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCT3P49368 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCT3P49368 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCT3P49368 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCT3P49368 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCT3P49368 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCT3P49368 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCT3P49368 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCT3P49368 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCT3P49368 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCT3P49368 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCT3P49368 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCT3P49368 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCT3P49368 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCT3P49368 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCT3P49368 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCT3P49368 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCT3P49368 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCT3P49368 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCT3P49368 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCT3P49368 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCT3P49368 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCT3P49368 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCT3P49368 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCT3P49368 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCT3P49368 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCT3P49368 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCT3P49368 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCT3P49368 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCT3P49368 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCT3P49368 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCT3P49368 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCT3P49368 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCT3P49368 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCT3P49368 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCT3P49368 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CCT3P49368 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCT3P49368 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCT3P49368 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCT3P49368 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCT3P49368 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCT3P49368 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCT3P49368 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCT3P49368 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCT3P49368 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCT3P49368 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCT3P49368 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCT3P49368 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCT3P49368 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCT3P49368 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCT3P49368 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCT3P49368 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCT3P49368 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCT3P49368 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCT3P49368 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCT3P49368 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCT3P49368 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCT3P49368 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCT3P49368 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCT3P49368 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCT3P49368 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCT3P49368 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCT3P49368 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCT3P49368 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCT3P49368 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCT3P49368 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCT3P49368 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCT3P49368 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCT3P49368 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCT3P49368 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCT3P49368 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCT3P49368 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCT3P49368 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCT3P49368 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCT3P49368 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCT3P49368 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCT3P49368 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCT3P49368 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCT3P49368 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCT3P49368 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCT3P49368 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCT3P49368 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCT3P49368 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCT3P49368 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCT3P49368 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCT3P49368 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCT3P49368 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCT3P49368 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCT3P49368 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCT3P49368 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCT3P49368 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCT3P49368 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCT3P49368 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCT3P49368 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCT3P49368 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCT3P49368 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCT3P49368 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCT3P49368 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms