Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPD2P43304 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPD2P43304 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPD2P43304 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPD2P43304 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPD2P43304 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPD2P43304 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPD2P43304 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPD2P43304 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPD2P43304 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPD2P43304 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPD2P43304 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPD2P43304 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPD2P43304 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPD2P43304 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPD2P43304 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPD2P43304 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPD2P43304 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPD2P43304 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPD2P43304 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPD2P43304 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPD2P43304 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPD2P43304 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPD2P43304 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPD2P43304 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPD2P43304 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPD2P43304 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GPD2P43304 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPD2P43304 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPD2P43304 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPD2P43304 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPD2P43304 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPD2P43304 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPD2P43304 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPD2P43304 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GPD2P43304 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPD2P43304 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPD2P43304 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPD2P43304 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPD2P43304 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPD2P43304 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPD2P43304 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GPD2P43304 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPD2P43304 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPD2P43304 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GPD2P43304 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GPD2P43304 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GPD2P43304 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPD2P43304 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPD2P43304 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPD2P43304 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPD2P43304 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPD2P43304 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPD2P43304 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPD2P43304 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPD2P43304 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPD2P43304 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPD2P43304 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPD2P43304 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPD2P43304 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPD2P43304 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPD2P43304 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPD2P43304 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPD2P43304 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPD2P43304 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPD2P43304 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPD2P43304 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPD2P43304 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPD2P43304 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GPD2P43304 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPD2P43304 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GPD2P43304 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPD2P43304 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GPD2P43304 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPD2P43304 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPD2P43304 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPD2P43304 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GPD2P43304 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPD2P43304 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPD2P43304 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPD2P43304 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPD2P43304 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPD2P43304 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPD2P43304 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPD2P43304 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPD2P43304 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPD2P43304 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPD2P43304 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPD2P43304 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPD2P43304 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPD2P43304 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPD2P43304 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPD2P43304 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPD2P43304 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPD2P43304 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPD2P43304 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPD2P43304 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPD2P43304 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPD2P43304 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPD2P43304 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms