Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRATP43155 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRATP43155 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRATP43155 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRATP43155 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRATP43155 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRATP43155 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRATP43155 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRATP43155 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRATP43155 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRATP43155 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRATP43155 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRATP43155 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRATP43155 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRATP43155 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRATP43155 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRATP43155 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRATP43155 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRATP43155 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRATP43155 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRATP43155 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRATP43155 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRATP43155 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CRATP43155 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRATP43155 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRATP43155 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRATP43155 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRATP43155 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRATP43155 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRATP43155 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRATP43155 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRATP43155 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRATP43155 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRATP43155 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRATP43155 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRATP43155 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRATP43155 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRATP43155 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRATP43155 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRATP43155 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRATP43155 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRATP43155 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRATP43155 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRATP43155 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRATP43155 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRATP43155 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRATP43155 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRATP43155 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRATP43155 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRATP43155 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRATP43155 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRATP43155 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRATP43155 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CRATP43155 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRATP43155 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRATP43155 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRATP43155 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRATP43155 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CRATP43155 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRATP43155 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CRATP43155 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRATP43155 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRATP43155 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRATP43155 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRATP43155 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRATP43155 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRATP43155 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRATP43155 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRATP43155 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRATP43155 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRATP43155 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRATP43155 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CRATP43155 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRATP43155 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRATP43155 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRATP43155 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRATP43155 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRATP43155 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRATP43155 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRATP43155 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRATP43155 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRATP43155 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRATP43155 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRATP43155 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRATP43155 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRATP43155 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRATP43155 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CRATP43155 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRATP43155 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CRATP43155 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CRATP43155 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRATP43155 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRATP43155 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRATP43155 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRATP43155 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRATP43155 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRATP43155 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CRATP43155 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRATP43155 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRATP43155 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms