Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC1P41238 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms