Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FDFT1P37268 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms