Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms