Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHI3L1P36222 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms